Homelander, épaulé par la stratège Sister Sage, s’allie à la vice-présidente Neuman pour consolider un pouvoir totalitaire, tandis que les Boys, fragilisés et déchirés, doivent s’unir malgré les mensonges de Butcher et le compte à rebours de sa maladie pour contrecarrer leurs plans. Après une tentative d’assassinat visant le président-élu Singer, l’équipe se réfugie dans un bunker, mais la saison se conclut sur un cliffhanger tendu où Homelander fait monter la tension politique à son paroxysme.