Huit ans se sont écoulés depuis la visite du paléontologue Alan Grant sur la fameuse île. Il poursuit ses recherches sur l'intelligence des vélociraptors mais manque cruellement de fonds. C'est alors qu'Amanda et Paul Kirby, un couple aisé, lui proposent un pont en or s'il leur fait survoler la fameuse île. Alan accepte avant de réaliser qu'il s'agit d'un piège. En effet, les Kirby n'ont qu'une seule chose en tête : sauver leur fils, Eric, qui a disparu dans les environs.